Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC018946.1-201ENST00000560578 458 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CUL4AQ13619 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CUL4AQ13619 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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CUL4AQ13619 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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CUL4AQ13619 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CUL4AQ13619 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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