Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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HOXC13P31276 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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HOXC13P31276 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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HOXC13P31276 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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HOXC13P31276 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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HOXC13P31276 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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HOXC13P31276 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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HOXC13P31276 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXC13P31276 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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