Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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