Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 RBMY1A3P-201ENST00000382670 1404 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FANCFQ9NPI8 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms