Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC9.34□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 VPS8-207ENST00000436792 5011 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRRIQ1Q96JM4 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms