Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 FADS2P1-201ENST00000611807 1446 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AGXT2-206ENST00000618015 2181 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 TRBV28-201ENST00000390400 364 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 NUSAP1-210ENST00000560177 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
NEDD1Q8NHV4 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms