Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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COL4A6Q14031 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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COL4A6Q14031 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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COL4A6Q14031 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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COL4A6Q14031 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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