Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 MAP1A-202ENST00000382031 10553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 SASH1-204ENST00000622663 5075 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CENPFP49454 XDH-201ENST00000379416 5688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 OR4M2-201ENST00000614722 1133 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 NSD2-212ENST00000503128 8568 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 POGZ-203ENST00000368863 6054 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CENPFP49454 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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CENPFP49454 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 CDH7-202ENST00000397968 12231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 ACTR3C-206ENST00000613959 5142 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 POGK-202ENST00000367876 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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CENPFP49454 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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CENPFP49454 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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CENPFP49454 SEMA6D-204ENST00000358066 5913 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 GPR161-210ENST00000546300 7388 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 PCYT1A-201ENST00000292823 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 MYO5A-202ENST00000358212 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 MYO5A-206ENST00000399233 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CENPFP49454 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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