Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP3Q9Y6F1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP3Q9Y6F1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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