Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF1Q9Y6D6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms