Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP16Q9Y5T5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP16Q9Y5T5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms