Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NRXN3Q9Y4C0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NRXN3Q9Y4C0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms