Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMED7Q9Y3B3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms