Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPR55Q9Y2T6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPR55Q9Y2T6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPR55Q9Y2T6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPR55Q9Y2T6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPR55Q9Y2T6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPR55Q9Y2T6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPR55Q9Y2T6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPR55Q9Y2T6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPR55Q9Y2T6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPR55Q9Y2T6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPR55Q9Y2T6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPR55Q9Y2T6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPR55Q9Y2T6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms