Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHA12Q9UN75 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHA12Q9UN75 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms