Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms