Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA11Q9UKX5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA11Q9UKX5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms