Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC9Q9UKV0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms