Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN11AQ9UI33 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN11AQ9UI33 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms