Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO40Q9UH90 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms