Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT172Q9UG01 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT172Q9UG01 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms