Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK2Q9UBU2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK2Q9UBU2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms