Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK4Q9UBT3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms