Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SAE1Q9UBE0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAE1Q9UBE0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms