Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGNQ9P2M7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNQ9P2M7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms