Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL42Q9P2K6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms