Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC59Q9P031 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC59Q9P031 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms