Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARHGEF12Q9NZN5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGEF12Q9NZN5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms