Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RDH8Q9NYR8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms