Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms