Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms