Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCIQ9NVI1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCIQ9NVI1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms