Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINM1Q9NU53 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GINM1Q9NU53 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms