Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms