Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCND1Q9NSA2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCND1Q9NSA2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms