Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BATF3Q9NR55 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms