Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC31BQ9NQW1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC31BQ9NQW1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms