Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB18Q9NP72 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB18Q9NP72 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms