Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELL3Q9HB65 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms