Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSPNQ9HAW4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSPNQ9HAW4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms