Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC52A2Q9HAB3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC52A2Q9HAB3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms