Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C11orf49Q9H6J7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C11orf49Q9H6J7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms