Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRDM12Q9H4Q4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms