Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MIXL1Q9H2W2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms