Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP44Q9H0E7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms