Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCL11BQ9C0K0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCL11BQ9C0K0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BCL11BQ9C0K0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCL11BQ9C0K0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCL11BQ9C0K0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BCL11BQ9C0K0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BCL11BQ9C0K0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
BCL11BQ9C0K0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCL11BQ9C0K0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms