Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXQ1Q9C009 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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