Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NMES1Q9C002 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms