Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF4Q9BZC1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CELF4Q9BZC1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms