Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC2Q9BYS8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms